La Subsecretaría de Ciencia e Innovación ejerce, con carácter general, las siguientes funciones:
- La representación ordinaria del Ministerio.
- Las relaciones institucionales del departamento con organismos y entidades de carácter público y privado, sin perjuicio de las competencias atribuidas a otros órganos.
- El ejercicio de las funciones establecidas en el artículo 68 de la Ley 40/2015 en materia de asesoramiento, apoyo técnico y gestión directa en el ámbito internacional en el caso de que no estén atribuidas expresamente a otros órganos del departamento.
- El apoyo al ministro y a los órganos directivos del departamento en la planificación y coordinación de la actividad del Ministerio, a través del correspondiente asesoramiento técnico.
- La elaboración y coordinación de los planes generales del departamento en materia normativa, de política presupuestaria, de personal y retributiva, de patrimonio, inmuebles e infraestructuras, de tecnologías de la información y comunicaciones, de programación económica y de control presupuestario.
- El impulso, coordinación, apoyo y supervisión de las actividades de elaboración de disposiciones generales del departamento, así como las gestiones relacionadas con su publicación.
- La dirección, impulso y gestión de las funciones relativas a la tramitación de los asuntos del Consejo de Ministros, Comisiones Delegadas del Gobierno y Comisión General de Secretarios de Estado y Subsecretarios.
- El impulso y coordinación de las relaciones del Ministerio de Ciencia e Innovación con los órganos jurisdiccionales, con los demás departamentos de la Administración General del Estado, con los delegados y subdelegados del Gobierno y con los restantes órganos periféricos.
- La dirección de la función inspectora sobre los servicios, organismos y centros dependientes del departamento, especialmente en lo que se refiere al personal, procedimiento, régimen económico, instalaciones y dotaciones de estos, así como la asistencia al ministro en las funciones de control de la actividad del departamento, realizando aquellas que permitan evaluar el funcionamiento, la eficacia y el rendimiento del personal y de los servicios del Ministerio.
- La gestión de los servicios administrativos, su racionalización e informatización, la estadística, la información y documentación administrativa y el despacho de los asuntos no atribuidos a la competencia de otros órganos del departamento.
Y con carácter particular, las atribuidas a sus respectivos órganos directivos dependientes:
- Secretaría General Técnica
- Subdirección General de Personal e Inspección de Servicios
- Subdirección General de Gestión Económica
- Subdirección General de Fondos Europeos para la Investigación y la Innovación
- Oficina Presupuestaria
- Oficialía Mayor
- División de Tecnologías de la Información
- Abogacía del Estado en el Departamento
- Intervención Delegada de la Intervención General de la Administración del Estado
- Instituto España y Reales Academias (IdeE)