Les instal·lacions incloses en esta infraestructura estan localitzades en el CNIC Carlos III de Madrid i estan en funcionament al complet des de 2010.
Estan organitzades en tres plataformes: Imatge Molecular i Funcional, Imatge Avançada i Imatge d'Alt Rendiment. La Unitat d'Imatge Molecular i Funcional dona servicis de microscòpia òptica i de fluorescència i desenvolupa noves aplicacions d'imatge que permeten aconseguir detalls moleculars també en mostres grans com a òrgans i organismes complets. Desenvolupen també aplicacions especials tals com a imatges d'àrees grans, seguiment de cèl·lules, reconeixement de formes, imatges multicolors i colocalización en 3D i 4D.
La Unitat d'Imatge Avançada oferix tecnologies d'avantguarda per a imatge d'òrgans amb cinc modalitats: Ressonància Magnètica (RM), imatge híbrida mitjançant fusió de micro-tomografia computarizada (TAC), i imatge nuclear-tomografia per emissió de positrons (PET), així com de RM/PET, ultrasons i òptica (fluorescència i luminescència bi- i tridimensional). A més, compta amb un laboratori dedicat a la nanotecnologia i la química orgànica que produïx nanopartícules multifuncionales i un laboratori de radioquímica que proporciona radiotrazadores per a les tècniques d'imatge preclínica disponibles en el centre.
La Unitat d'imatge d'Alt Rendiment és una infraestructura totalment automatitzada que proporciona l'última tecnologia en Citometría de flux per a mesurar simultàniament múltiples característiques òptiques de cadascuna de les partícules o cèl·lules presents en una suspensió, així com rastreig d'alt contingut (High Content Screening ) per al descobriment de nous fàrmacs i per a aproximacions de genòmica funcional utilitzant llibreries de siRNA.
