As instalacións incluídas nesta infraestrutura están localizadas no CNIC Carlos III de Madrid e están en funcionamento ao completo desde 2010.

Están organizadas en tres plataformas: Imaxe Molecular e Funcional, Imaxe Avanzada e Imaxe de Alto Rendemento. A Unidade de Imaxe Molecular e Funcional dá servizos de microscopia óptica e de fluorescencia e desenvolve novas aplicacións de imaxe que permiten alcanzar detalles moleculares tamén en mostras grandes como órganos e organismos completos. Desenvolven tamén aplicacións especiais tales como imaxes de áreas grandes, seguimento de células, recoñecemento de formas, imaxes multicolores e colocalización en 3D e 4D.

A Unidade de Imaxe Avanzada ofrece tecnoloxías de vangarda para imaxe de órganos con cinco modalidades: Resonancia Magnética (RM), imaxe híbrida mediante fusión de micro-tomografía computarizada (TAC), e imaxe nuclear-tomografía por emisión de positrones (PET), así como de RM/PET, ultrasóns e óptica (fluorescencia e luminiscencia bi- e tridimensional). Ademais, conta cun laboratorio dedicado á nanotecnoloxía e a química orgánica que produce nanopartículas multifuncionais e un laboratorio de radioquímica que proporciona radiotrazadores para as técnicas de imaxe preclínica dispoñibles no centro.

A Unidade de imaxe de Alto Rendemento é unha infraestrutura totalmente automatizada que proporciona a última tecnoloxía en Citometría de fluxo para medir simultaneamente múltiples características ópticas de cada unha das partículas ou células presentes nunha suspensión, así como rastrexo de alto contido (High Content Screening ) para o descubrimento de novos fármacos e para aproximacións de xenómica funcional utilizando librarías de siRNA.