El Centro de Publicaciones es el encargado de la coordinación de la acción editorial del Ministerio, además de colaborar en el diseño y ejecución de las publicaciones oficiales programadas.
Todas las publicaciones oficiales que se editen en el Ministerio deben estar dadas de alta en el Programa Editorial, que tiene carácter anual, y ha de ser aprobado por el titular del Departamento.
La acción editorial del Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades se desarrolla a través de las siguiente unidades editoras:
- El Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), que, al mismo tiempo que la propia, recoge la actividad editorial del instituto Geográfico y Minero Español (IGME), el Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA) y el instituto Español de Oceanografía (IEO).
- El Centro de Investigaciones Energéticas, Medioambientales y Tecnológicas (CIEMAT).
- El Instituto de Salud Carlos III (ISCIII).
- El Centro para el Desarrollo Tecnológico y la Innovación (CDTI).
- Servicio Español para la Internacionalización de la Educación (SEPIE)
- Agencia Nacional de Evaluación de la Calidad y Acreditación (ANECA)
- Universidad Internacional Menéndez Pelayo (UIMP)
- La Secretaría General Técnica, que coordina, a la vez que la propia, la actividad editorial de la Fundación Española para la Ciencia y la Tecnología (FECYT), la Secretaría General de Investigación, la Secretaría General de Innovación, la Unidad de Igualdad, etc.