El Centro de Publicaciones es el encargado de la coordinación de la acción editorial del Ministerio, además de colaborar en el diseño y ejecución de las publicaciones oficiales programadas.
Totes les publicacions oficials que s'editin en el Ministeri han d'estar donades d'alta en el Programa Editorial, que té caràcter anual, i ha de ser aprovat pel titular del Departament.
La acción editorial del Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades se desarrolla a través de las siguiente unidades editoras:
- El Consell Superior de Recerques Científiques (CSIC), que, al mateix temps que la pròpia, recull l'activitat editorial de l'institut Geogràfic i Miner Espanyol (IGME), l'Institut Nacional de Recerca i Tecnologia Agrària i Alimentària (INIA) i l'institut Español d'Oceanografia (IEO)
- El Centre de Recerques Energètiques, Mediambientals i Tecnològiques (CIEMAT)
- L'Institut de Salut Carles III (ISCIII)
- El Centre per al Desenvolupament Tecnològic i la Innovació (CDTI)
- La Fundació Espanyola per a la Ciència i la Tecnologia (FECYT)
- Servei Espanyol per a la Internacionalització de l'Educació (SEPIE)
- Agència Nacional d'Avaluació de la Qualitat i Acreditació (ANECA)
- Universitat Internacional Menéndez Pelayo (UIMP)
- La Secretaría General Técnica, que coordina, a la vez que la propia, la actividad editorial de la Secretaría de Estado , la Secretaría General de Investigación, la Secretaría General de Innovación , la Secretaría General de Universidades , y la Dirección General de Planificación, Coordinación y Transferencia del Conocimiento.