CNIO Fundazioaren helburua da ikerketa onkologikoa sustatzea eta arlo horretako zientzia- eta osasun-aurrerapenak sustatzea. Minbiziaren alderdi oinarrizkoenak ikertzen ditu, hala nola geneak eta haren garapenean parte hartzen duten prozesu zelularrak, eta estrategia terapeutiko eta farmako berriak bilatzen ditu. Minbizia ikertzeko eskala globaleko zentro onenetako bat da, erakunde independenteek egindako sailkapenen arabera.
Onkologo klinikoekin lan egiten du eta berrikuntza egiten du, patenteak sortuz, industriarekin kolaboratuz eta spin-off enpresak sortuz. Beste zientzialari batzuei ere zerbitzuak eskaintzen dizkiegu eta minbiziaren diagnostikoan eta pronostikoan laguntza eskaintzen dugu.
