La Secretaría General de Investigación ejerce funciones de dirección en materia de ciencia, innovación y universidades, así como el impulso de la consecución de objetivos y la ejecución de los proyectos de su organización.
Son també funcions d'aquesta Secretaria General:
- Dirección de las competencias atribuidas al departamento en materia de ciencia, innovación y universidades.
- La gestió dels premis nacionals en matèria de recerca.
- La gestión de programas operativos cofinanciados por fondos de la Unión Europea.
- La direcció estratègica de l'Agència Estatal Consell Superior de Recerques Científiques (CSIC), l'Organisme Autònom Institut de Salut Carles III (ISCIII), i l'Organisme Autònom Centre de Recerques Energètiques, Mediambientals i Tecnològiques (CIEMAT).
- El impulso de la participación española en los programas de fomento de la I+D+I promovidos por la Unión Europea.
- La planificación estratégica, coordinación, seguimiento y representación de grandes instalaciones científico-técnicas nacionales con Comunidades Autónomas y de carácter estatal.
- La representació internacional de grans instal·lacions cientificotècniques espanyoles.
- El apoyo a la coordinación, promoción y seguimiento de la investigación, desarrollo e innovación polar.
- La coordinación de los organismos y entidades públicas vinculadas o dependientes de la Secretaría General de Investigación.
Aquesta Secretaria General es compon dels següents òrgans directius:
- La Subdirecció General de Consorcis, Organismes i Infraestructures Científiques Internacionals.
- La Subdirecció General de Grans Instal·lacions Cientificotècniques.
- La Subdirecció General d'Organismes i Entitats Públiques de Recerca.
S'adscriuen a aquesta Secretaria General:
- Consell Superior de Recerques Científiques (CSIC).
- Institut de Salut Carles III (ISCIII).
- Centre de Recerques Energètiques, Mediambientals i Tecnològiques (CIEMAT).
- Institut d'Astrofísica de Canàries.
Secretària general de Recerca:Sra. Eva Ortega-Paíno
