En el CIBER treballen conjuntament investigadors bàsics i clínics per a facilitar que la recerca de laboratori arribi als pacients de manera àgil i segura, evitant duplicitats, aconseguint resultats àgils i transferint els resultats de la recerca a la indústria i a la societat. L'ISCIII, per la seva condició d'ens promotor i finançador majoritari, exerceix les funcions de seguiment i control de totes les seves activitats.
Inclou tretze àrees temàtiques presents en gairebé totes les CCAA:
- Bioingeniería, Biomaterials i Nanomedicina (CIBERBBN),
- Malalties Estranyes (CIBERER),
- Malalties Respiratòries (CIBERES),
- Malalties Hepàtiques i Digestives (CIBEREHD),
- Epidemiologia i Salut Pública (CIBERESP),
- Salut Mental (CIBERSAM),
- Diabetis i Malalties Metabòliques (CIBERDEM),
- Fisiopatologia de l'Obesitat i Nutrició (CIBEROBN),
- Fragilitat i Envelliment (CIBERFES),
- Malalties Cardiovasculars (CIBERCV),
- Càncer (CIBERONC),
- Malalties Neurodegeneratives (CIBERNED), i
- Malalties Infeccioses (CIBERINFEC).