La Flota Oceanogràfica Espanyola està constituïda per 10 vaixells gestionats per diferents organismes. La COCSABO (Comissió de Coordinació i Seguiment de les Activitats dels Vaixells Oceanogràfics) és l'òrgan col·legiat responsable de la coordinació de l'activitat científica i tècnica realitzada pels vaixells d'aquesta ICTS distribuïda.
El Vaixell de Recerca Oceanogràfica (BIO) Hespérides és un vaixell de la Força d'Acció Marítima de l'Armada Espanyola amb base en Cartagena. El seu equipament científic és gestionat per la Unitat de Tecnologia Marítima del CSIC. Compta amb un casc reforçat per a la navegació en zones polars. La seva missió principal és el suport a la campanya antàrtica durant l'estiu austral; opera la resta de l'any al Mediterrani i els oceans Atlàntic i Pacífic.
La Flota del CSIC està composta per tres vaixells i per un conjunt d'instruments científics operables des de qualsevol de les naus de la FLOTA.
-
B/O Sarment de Gamboa
-
B/O García del Cid
-
B/O Mytilus
La FLOTA de l'Institut Espanyol d'Oceanografia està composta de 5 vaixells, i un equip d'operació remota (ROV) capaç d'aconseguir els 2000 m de profunditat.
-
B/O Ángeles Alvariño
-
B/O Ramón Margalef
-
B/O Francisco de Paula Navarro
-
B/O José María Navaz
-
B/O Lura
