A Frota Oceanográfica Española está constituída por 10 buques xestionados por distintos organismos. A COCSABO (Comisión de Coordinación e Seguimento das Actividades dos Buques Oceanográficos) é o órgano colexiado responsable da coordinación da actividade científica e técnica realizada polos buques desta ICTS distribuída.
O Buque de Investigación Oceanográfica (BIO) Hespérides é un buque da Forza de Acción Marítima da Armada Española con base en Cartaxena. O seu equipamento científico está xestionado pola Unidade de Tecnoloxía Marítima do CSIC. Conta cun casco reforzado para a navegación en zonas polares. A súa misión principal é o apoio á campaña antártica durante o verán austral, operando o resto do ano no Mediterráneo e os océanos Atlántico e Pacífico.
A Frota do CSIC está composta por tres buques, e por un conxunto de instrumentos científicos operables desde calquera das naves da FROTA.
- B/O Sarmiento de Gamboa
- B/O García del Cid
- B/O Mytilus
A FROTA do Instituto Español de Oceanografía está composta de 5 buques, e un equipo de operación remota (ROV) capaz de alcanzar os 2000m de profundidade.
- B/O Ángeles Alvariño
- B/O Ramón Margalef
- B/O Francisco de Paula Navarro
- B/O José María Navaz
- B/O Lura