O CENIEH é un consorcio público cofinanciado a partes iguais pola Administración Xeral do Estado e a Xunta de Castela e León, con sede en Burgos.
O CENIEH é responsable da xestión e conservación das coleccións paleontológicas e arqueolóxicas procedentes das escavacións de Atapuerca e outros xacementos, nacionais ou internacionais, de similares características que cheguen a acordos co Centro.
Os seus laboratorios, considerados infraestruturas esenciais e que lle confiren a súa singularidade como ICTS, agrúpanse en tres áreas temáticas:
- área de sedimentología e caracterización de materiais,
- área de geocronología
- área de coleccións, conservación e restauración.
