O Centro Nacional de Microscopía Avanzada (Principal acción Transversal do Campus de Excelencia Internacional Moncloa), está deseñado, de acordo con o estudo realizado pola FECYT sobre Instalacións Científico-Tecnolóxicas Singulares (ICTS) para desenvolver, implementar e ofertar á comunidade científica nacional e internacional os métodos e técnicas máis avanzados en microscopia electrónica de transmisión e varrido para a análise estrutural de materiais. Este Centro consta dunha serie de microscopios de última xeración, e de instrumentos e técnicas para a preparación avanzada de mostras, así como para a aplicación de métodos computacionales de tratamento de imaxes. Para ser referente científico nacional e internacional, este microscopios, dispoñen de complementos técnicos-científicos que aumentan exponencialmente o seu potencial.

Este tipo de instrumentos dá ao Centro unha absoluta singularidade, xa que non existe un conxunto de técnicas de microscopía deste tipo en ningún laboratorio Español e Internacional e posibilita, por tanto, un traballo coordinado e nas mellores condicións metodolóxicas para todo o proceso de estudo, desde a preparación de mostras ata o tratamento matemático máis avanzado para a resolución de estruturas.