Els Estats membres elaboren els Programes Operatius del FEDER plurirregionales, els quals contribuïxen a l'aplicació de l'estratègia de la Unió per a un creixement intel·ligent, sostenible i integrador i a l'assoliment de la cohesió econòmica, social i territorial.
L'últim Programes Operatiu plurirregional a Espanya aprovat en l'àmbit dels FEDER és el Programa Operatiu Plurirregional d'Espanya (POPE) 2014-2020.