Unha das melloras no goberno que se introduce, tanto na reforma da Lei da Ciencia, a Tecnoloxía e a Innovación como na EECTI, é un novo mecanismo de execución das políticas de I+D+I coordinado entre o Estado e as Comunidades Autónomas: os Plans Complementarios coas Comunidades Autónomas.
Os Plans Complementarios son colaboracións coas CCAA en accións de I+D+I nas que conflúan prioridades comúns do plan estatal e dos plans rexionais, que permiten establecer sinerxías en áreas estratéxicas reflectidas na Estratexia de Especialización Intelixente (RIS3) estatal e autonómica. Trátase de crear sinerxías, aliñar a execución de fondos e establecer prioridades comúns.
Seleccionáronse 8 Áreas de interese científico-técnicas dentro das liñas da EECTI: Comunicación Cuántica, Enerxía e Hidróxeno Verde, Agroalimentación, Biodiversidade, Astrofísica e Física de Altas Enerxías, Ciencias Mariñas, Materiais avanzados, Biotecnoloxía en Saúde.
Co propósito de construír sinerxías territoriais, os Plans Complementarios consideran a participación de varias CCAA nun programa, coa posibilidade de participar en varios proxectos. Lógrase así o aproveitamento de capacidades e infraestruturas singulares, xunto coa posible participación de empresas. Os programas terán unha duración de 2-3 anos, con compromisos de co-financiamento e mecanismos de co-goberno, potenciando a transformación económica territorial.
O obxectivo é subscribir 4 convenios de colaboración en 2021 en 4 das áreas de interese e outros 4 en 2022 que cubran o resto das áreas científico-técnicas.