El Ministerio, bajo la superior dirección del titular del departamento, desarrolla las funciones que legalmente le corresponden.
El Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades se estructura en los siguientes órganos directivos:
Organigrama del Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades
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Real Decreto 472/2024, de 7 de mayo, por el que se desarrolla la estructura orgánica básica del Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades
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Real Decreto 1009/2023, de 5 de diciembre, por el que se establece la estructura orgánica básica de los departamentos ministeriales
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Real Decreto 829/2023, de 20 de noviembre, por el que se reestructuran los departamentos ministeriales
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